Vencieron más veces a Alianza Lima y Cristal en torneo continental
Universitario tiene supremacía sobre el resto de equipos peruanos en Copa Libertadores, la página oficial del torneo, publicó un listado de los diez choques más repetidos en su historia y en décimo lugar aparece el Superclásico contra Alianza Lima, y en noveno otro clásico ante Sporting Cristal y en ambos tienen historial a favor.
Contra el «compadre» la paternidad es absoluta, ya que de 12 enfrentamientos ganaron 7, empataron 3 y perdieron solamente 2. El último fue el 23 de marzo de 1994 y ganaron 2-1 en Matute, con los goles de Jorge Amado Nunes y Dolmo Flores y sus victorias más recordadas fueron el 6-3 en Matute de 1979 y el 2-0 en el Nacional de 1988, cuando los íntimos abandonaron el partido por expulsiones y lesiones.
Por otro lado, contra Cristal registran 5 triunfos, 6 empates y 3 derrotas.
